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1、影响后代：慢性尿道炎患者会使自己的伴侣也被感染，受感染的女性伴侣生出来的孩子可能会患上结膜炎。
2、造成关节炎：感染严重时，细菌侵犯到膝关节内会造成关节炎。
3、引起各种不适症状：慢性尿道炎会引起各种不适症状。这因为病菌在感染尿道后，会在尿道上造成脓疡，日后结疤的结果会使尿道狭窄，病患会感到小便困难及尿流细小。
4、引发男性不育：慢性尿道炎还会引发男性不育。摄护腺可能受到侵袭产生摄护腺炎，病患会有会阴部疼痛及下背部疼痛的症状，严重时会导致不孕。

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